5. 严格监管
每年起草、印发绿色食品等“三品一标”监管工作意见，明确全市监管工作任务和重点，确定证后监督抽检方案、综合监督检查方案，高质量开展证后监管工作。
一是产品监督抽检。每年委托农业部农产品质量安全监测检测中心（重庆）按照年初绿色食品总有效数的10%抽检。根据抽检结果，上下半年各组织召开1次检测数据分析会，分析查找安全隐患，提前介入舆情风险控制。近年来，无论是监督抽检还是例行监测，合格率均为100%。
二是市场监察。按照中国绿色食品发展中心要求，认真开展绿色食品市场监察工作。市农产品质量安全中心负责对中国绿色食品发展中心确定的重庆百货和新世纪百货2个固定市场上标称绿色食品的产品进行了包装标识检查，连续3年，均未发现不规范用标情况。对重庆市产品在全国其它市场上的不规范用标行为，按照中国绿色食品发展中心的要求，及时进行处置。
三是企业年检。首先，发文给各区县工作机构及相关企业，按照属地管理原则，明确绿色食品年检工作任务，各区县按照标准进行自检；其次，组织检查员和监管员对部分区县进行年检工作示范，进行年检业务知识培训，特别是年检“三联单”的规范应用与管理，指导各区县按时、保质保量完成年检工作；第三，结合区县年检企业数和平时工作情况，组织督导抽查，督导采取现场检查、召开座谈会方式进行，综合评价年检工作质量，防止年检不实不严的现象。
四是跟踪巡查。每年开展交叉跟踪巡查专项监督检查，抽调部分区县检查员，由市农产品质量安全中心领导或科长带队，组成巡查督导工作小组，对全市16个区县工作机构工作开展情况进行交叉督查；抽取48个绿色食品企业，对照《绿色食品标志许可审查工作规范》《绿色食品现场检查工作规范》，查看材料受理登记、申请审查质量、现场检查过程再现、检查报告规范等内容；深入绿色食品企业，查看生产记录、核实标志证书载明的生产规模、内检员配置、生产技术规程管理制度执行、企业绿色文化宣传等情况；同检查员、企业内检员座谈，了解绿色食品标志许可申报及审查工作中存在的问题和实际困难，听取他们对绿色食品发展工作的建议意见，客观评价工作机构的工作开展情况，提出改进要求。
五是追溯管理。根据《农业部关于加强农产品质量安全全程监管的意见》（农质发〔2014〕1号），重庆市于2014年启动了农产品质量安全追溯管理云平台建设，包括企业应用平台、政府监管平台、公众查询平台、追溯管理大数据资源库和移动监管APP。云平台具备市、区（县）、乡（镇）三级监管、企业应用、公众查询的追溯管理功能和违规使用农产品投入品的预警预报功能，能满足基本业态的农产品生产全程可追溯管理需求。农产品质量安全追溯管理云平台首先将“三品一标”纳入追溯管理，不断拓展和提升追溯管理云平台的功能模块，加强了区县和企业追溯管理云平台的推广应用与技术指导。在企业新申报绿色食品标志许可时，把追溯管理作为前置条件，推进全程追溯，确保产品质量与品牌信誉。
截至2017年底，进入追溯管理云平台的区县工作机构有61个、乡镇监管站有645个，各级追溯管理信息员有989名。云平台入驻企业802家，其中“三品一标”企业448家，占平台总数的56%，占全市“三品一标”企业1469家的30%；绿色食品298家，占绿色食品企业416家的71.63%；追溯产品6800批次，使用追溯二维码90余万个。
